«کهکشان نیستی» داستان زندگی آیت‌الله سیدعلی قاضی طباطبایی را روایت می‌کند. کتاب با داستان زندگی او از آغاز ورود به نجف اشرف در سن 27 سالگی شروع می‌شود و با رشد و نمو معنوی و نیز سیر و سلوک عرفانی و رسیدن به درجات عالی از عرفان و زهد و تربیت، شاگردان بی‌شماری که هر کدام در علم و دین و معرفت الگوی دیگران قرار گرفتند، ادامه می‌یابد و تا آخر عمر پربرکت ایشان روایت می‌گردد. کتاب 72 فصل در روایت‌های مختلف دارد که در مجموع تعداد راویان کتاب، عدد قابل‌توجهی از اعضای خانواده، اساتید، شاگردان، دوستان، گاهی دشمنان و گاهی هم دانای کل در قالب عناصری مانند ارض نجف و شمس و... را شامل می‌شود.